&

前言：想要寫出一篇引人入勝的文章？我們特意為您整理了HPV基因芯片裝置的勻光照明設(shè)計(jì)研究范文，希望能給你帶來靈感和參考，敬請(qǐng)閱讀。

HPV基因芯片裝置的勻光照明設(shè)計(jì)研究

摘要：人乳頭瘤病毒(hpv)基因芯片檢測(cè)裝置可讀取與分析HPV芯片的雜交點(diǎn)信號(hào)值，進(jìn)而區(qū)分不同的HPV病毒類型，而檢測(cè)裝置照明的均勻性關(guān)系到HPV芯片圖像處理算法的可靠性與難度。為實(shí)現(xiàn)均勻照明，優(yōu)化了矩形LED陣列排布并配置勻光擴(kuò)散板。首先，分析單個(gè)LED燈珠的輻射強(qiáng)度分布，建立矩形LED陣列的理論模型；然后，在仿真軟件中建立4行8列的矩形LED陣列模型；最后，搭建HPV基因芯片檢測(cè)裝置進(jìn)行實(shí)驗(yàn)測(cè)試。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，該照明系統(tǒng)能使70mm×20mm的目標(biāo)被照面的灰度均勻度達(dá)到95.6%，滿足了HPV基因芯片檢測(cè)裝置均勻照明的要求。

關(guān)鍵詞：HPV基因芯片；矩形LED陣列；勻光照明；灰度均勻度

引言

人乳頭瘤病毒(humanpapillomavirus，HPV)是一種DNA病毒，目前已鑒定出100多種HPV亞型，根據(jù)其致病力分為高危型和低危型，而高危型HPV持續(xù)感染是宮頸癌的主要致病因素[1]。HPV感染的檢測(cè)及基因分型是處理宮頸病變的重要依據(jù)，通過定期進(jìn)行高危型HPV篩查，有助于預(yù)防和早期發(fā)現(xiàn)宮頸癌[2]。在用HPV基因芯片檢測(cè)時(shí)，采用生物素標(biāo)記引物對(duì)少量待測(cè)的樣本DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增后的產(chǎn)物和固定在硝酸纖維素膜上的特異性探針進(jìn)行雜交，雜交后經(jīng)過相應(yīng)的顯色反應(yīng)便顯現(xiàn)出藍(lán)色的信號(hào)點(diǎn)，依據(jù)雜交點(diǎn)的信號(hào)值來對(duì)HPV的感染情況進(jìn)行分型。目前HPV基因芯片檢測(cè)結(jié)果是依靠人工肉眼判讀[3]，但人工判讀效率低下，且沒有數(shù)字化處理，無法為患者提供完善的數(shù)據(jù)分析。

HPV基因芯片檢測(cè)裝置照明系統(tǒng)是HPV基因芯片檢測(cè)裝置的重要組成部分，照明系統(tǒng)應(yīng)有好的光照均勻性，這樣可以降低后續(xù)圖像處理算法的難度與提高算法的可靠性。常見的可見光源主要有熒光燈、鹵素?zé)艉蚅ED光源。由于LED光源有快速可調(diào)和節(jié)能等優(yōu)點(diǎn)，許多基因芯片檢測(cè)儀逐漸采用LED燈作為照明光源[4]。為解決單顆LED無法實(shí)現(xiàn)大面積均勻照明的問題，通常采用多顆LED組成照明光源，并以矩形陣列形式排布所有單顆LED，使被照?qǐng)鼍矮@得均勻照明[5]，進(jìn)而為后續(xù)獲取優(yōu)質(zhì)的圖像創(chuàng)造好的條件。因此，本文結(jié)合HPV基因芯片照明范圍的實(shí)際需求，通過優(yōu)化矩形LED陣列的排布和配置勻光擴(kuò)散板來實(shí)現(xiàn)檢測(cè)裝置的均勻照明。

1基本原理

1.1HPV基因芯片檢測(cè)原理

HPV基因芯片檢測(cè)裝置，主要由HPV基因芯片、模組相機(jī)、矩形LED陣列光源和計(jì)算機(jī)等組成。矩形LED陣列光源提供均勻照明，模組相機(jī)采集HPV基因芯片圖像并通過USB數(shù)據(jù)線傳給計(jì)算機(jī)，計(jì)算機(jī)通過圖像處理算法提取出雜交點(diǎn)的信號(hào)值。LED陣列面到HPV芯片表面的距離與模組相機(jī)的工作距離都為60mm，模組相機(jī)的鏡頭直徑為14mm。HPV芯片為65mm×10mm的長條形區(qū)域，相機(jī)的拍攝范圍需大于HPV芯片的尺寸。因此，光源的照射范圍需要覆蓋整個(gè)拍攝范圍，由此確定矩形LED陣列光源的照射區(qū)域?yàn)?0mm×20mm。HPV基因芯片探針點(diǎn)排列，雜交點(diǎn)信號(hào)值反映的是雜交點(diǎn)的積分光密度(IOD)。圖中，PC為聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）擴(kuò)增反應(yīng)控制點(diǎn)，CC為顯色反應(yīng)控制點(diǎn)，其他的為各型別檢測(cè)點(diǎn)。如果PC點(diǎn)、CC點(diǎn)和型別檢測(cè)點(diǎn)的IOD分別大于或等于相應(yīng)的參考臨界值(cutoff值)，那么就感染了相應(yīng)型別的HPV病毒。例如，假設(shè)圖2中PC、CC和16型檢測(cè)區(qū)存在雜交信號(hào)點(diǎn)，并且它們的IOD分別大于或等于相應(yīng)的cutoff值，說明其感染了HPV16型病毒。1.2單個(gè)LED光源模型單個(gè)LED光源并非都是理想的朗伯體，其光強(qiáng)分布為發(fā)光角度余弦值的多次方函數(shù)[6-9]。如果LED所發(fā)出的光線照射到與其光軸方向垂直的平面上，該平面上光強(qiáng)的表達(dá)式為I(θ)=I0cosmθ(1)θI0(θ=0)θ1/2式中：為光線與光軸間的夾角；為沿軸向方向與LED距離為r的光強(qiáng)；m為光輻射模式。當(dāng)發(fā)光強(qiáng)度值為軸向強(qiáng)度值一半時(shí)，光線與光軸間的夾角定義為LED的半光強(qiáng)角，那么m值由其半光強(qiáng)角確定[7]。

1.2單個(gè)LED光源模型

單個(gè)LED光源并非都是理想的朗伯體，其光強(qiáng)分布為發(fā)光角度余弦值的多次方函數(shù)[6-9]。如果LED所發(fā)出的光線照射到與其光軸方向垂直的平面上，該平面上光強(qiáng)的表達(dá)式為I(θ)=I0cosmθ(1)θI0(θ=0)θ1/2式中：為光線與光軸間的夾角；為沿軸向方向與LED距離為r的光強(qiáng)；m為光輻射模式。當(dāng)發(fā)光強(qiáng)度值為軸向強(qiáng)度值一半時(shí)，光線與光軸間的夾角定義為LED的半光強(qiáng)角，那么m值由其半光強(qiáng)角確定[7]，假設(shè)單顆LED在xy平面上的坐標(biāo)為，z表示LED到平面之間的距離，被照面上有一觀測(cè)點(diǎn)，則該LED在H點(diǎn)處的照度[9]

2矩形LED陣列均勻照明設(shè)計(jì)

由于單個(gè)LED無法滿足HPV基因芯片檢測(cè)裝置的照明要求，為了達(dá)到照明范圍為70mm×20mm的需求，最常用的照明方式就是優(yōu)化矩形LED陣列，假設(shè)矩形陣列中LED為P×Q顆，由于LED為非相干光源，那么被照面上的照度為單個(gè)LED照度的疊加，根據(jù)斯派羅法則求解最大限度平坦條件[8,10]，可以解決目標(biāo)被照面上的均勻性照明問題。因x=0y=0∂2E/∂x2=0z=60mm此，對(duì)式(5)中的x變量求二階偏導(dǎo)，在、處，令，并且LED陣列面到HPV芯片被照面的距離，只要確定參數(shù)P，Q，m的值，就可以得到關(guān)于d的最大限度平坦條件，然后通過MATLAB編程求解d的值。θ1/2m=20P=4Q=8假定矩形陣列使用32顆(4行8列)半光強(qiáng)角為15°的LED，其位置排布如圖4所示。由式(2)可得，已知、，那么由式(6)可得d=19.1mm。在Tracepro軟件中對(duì)上述設(shè)計(jì)的矩形LED陣列進(jìn)行仿真，根據(jù)表面光源特性生成器工具構(gòu)建光源模型。當(dāng)LED矩形陣列模型中、Q=8、m=20、z=60mm、d=19.1mm時(shí)，追跡3.2×106條光線，得到結(jié)果如圖5所示。采用5點(diǎn)測(cè)量法進(jìn)行均勻度測(cè)試，分別測(cè)出區(qū)域中5點(diǎn)的照度值，然后將其中的最小照度值除以最大照度值即得到目標(biāo)被照面的照度均勻性[10]，在矩形LED陣列的照明區(qū)域中，沿x軸方向從−35mm至+35mm，沿y軸方向從−10mm至+10mm歸一化的最小照度為0.88，最大照度為0.99，照度均勻性至少為88.9%。

3實(shí)驗(yàn)測(cè)試

HPV基因芯片檢測(cè)裝置搭建實(shí)驗(yàn)測(cè)試平臺(tái)。為了去除環(huán)境光對(duì)圖像質(zhì)量的影響，整個(gè)測(cè)試在啞光亞克力做成的暗盒當(dāng)中進(jìn)行。HPV基因芯片選自泰普生物科學(xué)(中國)有限公司的人乳頭瘤病毒(23個(gè)型)基因分型檢測(cè)試劑盒。模組相機(jī)使用深圳市金乾象科技有限公司的可調(diào)焦CMOS相機(jī)，相機(jī)的型號(hào)為KS5A00、像素為500萬以及鏡頭直徑為14mm。光源采用自行設(shè)計(jì)的4行8列矩形LED陣列。電源采用普源精電科技有限公司的DP831A直流電源。由于HPV芯片材質(zhì)為尼龍膜，其大部分區(qū)域?yàn)榘咨尘?，因而測(cè)試時(shí)采用與其材質(zhì)接近的白色紙板。通過上位機(jī)拍攝白色紙板圖像并截取70mm×20mm的待測(cè)區(qū)域，該圖片像素大小為1547×411。

網(wǎng)格測(cè)量法是通過測(cè)試每個(gè)網(wǎng)格的平均照度來評(píng)價(jià)照度均勻性的方法，在一定條件下照度和灰度之間存在線性關(guān)系[11-13]，并且需要測(cè)量的是均勻性而不是網(wǎng)格中具體的照度值。因此，本文采用圖像處理的方法得到待測(cè)區(qū)域中每個(gè)網(wǎng)格的平均灰度，并用灰度均勻度來評(píng)價(jià)照明均勻性。首先，將灰度化后的待測(cè)區(qū)域圖像劃分為GminGavM×N個(gè)網(wǎng)格；然后，在每個(gè)網(wǎng)格中心處取50×50的像素塊并對(duì)該像素塊的灰度值取平均，得到M×N個(gè)灰度值；最后，用M×N個(gè)灰度值中的最小值除以M×N個(gè)灰度值的平均值，即得到灰度均勻度。

按照上述均勻度測(cè)試的方法將均勻度待測(cè)圖像劃分為30個(gè)網(wǎng)格，如圖7所示。每個(gè)網(wǎng)格中截取的50×50像素塊的灰度平均值如表1所示，由式(7)可得所設(shè)計(jì)的矩形LED陣列光照均勻度為89.4%，與仿真結(jié)果基本一致。為了實(shí)現(xiàn)更加均勻和柔和的照射效果，在矩形LED陣列下方加入勻光擴(kuò)散板。保持相機(jī)的曝光參數(shù)不變，調(diào)節(jié)直流電源的測(cè)試電壓，從而產(chǎn)生不同的光照強(qiáng)度，分別計(jì)算在不同光照強(qiáng)度下被照面的灰度均勻度并記錄到表2。從表2可以得到被照面的灰度均勻度為95.6%，滿足HPV芯片檢測(cè)裝置的均勻度要求。在環(huán)境光下采集到的HPV基因芯片，從圖中可以看到，左邊的光照強(qiáng)度大于右邊的光照強(qiáng)度。在該環(huán)境光下拍攝白色紙板得到的，采用同樣的均勻度測(cè)試方法得到灰度均勻度為77.7%。采用本文設(shè)計(jì)的光源系統(tǒng)照射HPV基因芯片，相機(jī)采集到的圖像。

4結(jié)論

本文設(shè)計(jì)了由矩形LED陣列與勻光擴(kuò)散板組成的照明系統(tǒng)，解決了HPV基因芯片檢測(cè)裝置的照明均勻性問題。通過Tracepro軟件，仿真了LED矩形陣列在被照面上所要求范圍內(nèi)的照度分布，并通過照度分布圖來評(píng)價(jià)照明的均勻性。對(duì)排布為4行8列的LED矩形陣列光源進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)測(cè)試，結(jié)果表明，在被照面上灰度均勻度可達(dá)89.4%，如在矩形LED陣列下方加入勻光擴(kuò)散板，則被照面上的灰度均勻度可達(dá)95.6%。與用環(huán)境光照明HPV基因芯片效果相比較，本照明系統(tǒng)具有更好的照明均勻度，因而能獲得更好的成像效果，給后續(xù)圖像的處理帶來了便利。

參考文獻(xiàn)：

杜宏,索蘭草,劉紅賢,等.甘肅地區(qū)女性宮頸HPV感染的現(xiàn)狀研究[J].暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版),2015,36(1):40–45.

[1]張達(dá)衡,陳紅玲,楊春媚,等.宮頸組織病變與檢測(cè)HPV基因分型的意義[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2013,34(13):1664–1665.

[2]張滿娥,黃文蓉,張洪彬.1456例女性HPV基因分型結(jié)果的回顧分析[J].分子診斷與治療雜志,2013,5(1):32–35.

[3]涂思聰,劉威.適用于著色標(biāo)定基因芯片的雜交檢測(cè)儀[J].自動(dòng)化與儀表,2013,28(7):11–13.

[4]肖韶榮,李曼.一種LED照明光源均勻度設(shè)計(jì)[J].應(yīng)用光學(xué),2015,36(4):600–605.

[5]陳新睿,韓敬華,李洪儒,等.基于近場(chǎng)均勻照明的LED陣列的優(yōu)化設(shè)計(jì)[J].應(yīng)用光學(xué),2014,35(1):122–127.

[6]甘振華,杜民,高躍明,等.單芯大功率LED勻光照明陣列的設(shè)計(jì)[J].光學(xué)儀器,2016,38(6):505–511.

[7]肖韶榮,楊麗,吳群勇,等.紫外LED圓環(huán)陣列均勻照明的實(shí)現(xiàn)方法[J].應(yīng)用光學(xué),2013,34(5):742–747.

[8]侯啟真,薛榮榮,王潔寧.LED陣列發(fā)光特性仿真和對(duì)比分析[J].液晶與顯示,2017,32(12):961–967.

[9]張寧.LED面光源均勻化設(shè)計(jì)[D].南京:南京信息工程大學(xué),2012.

[10]劉璐,鄭繼紅,李道萍,等.基于菌落挑選儀的暗視場(chǎng)照明的優(yōu)化設(shè)計(jì)[J].光學(xué)技術(shù),2017,43(3):243–247.

[11]王鈞,朱繼紅,馮醒,等.基于CCD和MATLAB的等照度線繪制方法[J].照明工程學(xué)報(bào),2013,24(4):40–43.

[12],王崢,李敏.基于菌群算法的飛機(jī)鉚釘表面缺陷檢測(cè)系統(tǒng)光源優(yōu)化控制[J].液晶與顯示,2017,32(11):895–904.

[13]，王崢，李敏. 基于菌群算法的飛機(jī)鉚釘表面缺陷檢測(cè)系統(tǒng)光源優(yōu)化控制 [J]. 液晶與顯示, 2017,32(11): 895 – 904.

作者：劉憶惠陳建國甘振華杜民高躍明單位：福州大學(xué)物理與信息工程學(xué)院福建工程學(xué)院信息科學(xué)與工程學(xué)院