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MiRNA的檢測技術很多,既有傳統的Northernblotting技術、實時定量PCR技術和RNA芯片技術,也有最近發展起來的結合物理和化學方法建立的銀染增強放大技術、共振能量轉移技術、拉曼光譜分析技術和生物傳感技術等。
1Northernblotting技術
該技術是目前很可靠的檢驗技術,但是所需要的樣品較多,檢測周期也比較長,其敏感性也不是很好。為此研究人員發展了LNA技術。LNA是一種類寡核酸的衍生物,使用其進行雜交可顯著提高雜交的敏感性和雜交效率,大約是傳統雜交方法的10倍,而且并且僅用2h完成。[3]此外,,Pall等[4]采用了可溶性的碳化二亞胺來代替傳統的紫外交聯法把miRNA轉移至尼龍膜上,使檢測敏感度提高了25-50倍。通過以上這些改進,Northernblotting技術將在很大程度上促進miRNA檢測技術在臨床實驗宅的順利開展。
2實時定量PCR技術
其是檢測miRNA最常用的技術。可用于檢測各種組織中的miRNA表達以及表達量,包括血液、腫瘤組織以及其他病理組織等。Mitchell等使用經典的Taq-Man熒光定量RT-PCR技術定量分析了健康志愿者血漿中的miR-15b、miR-16和miR-24。同時,他們還使用該方法定量測定了從前列腺癌血漿標本中篩選出來的6個miRNA,結果顯示,miR-141在前列腺癌患者血漿中的表達量明顯升高(是健康人的46倍),同時他們對miR-141的表達水平同PSA的水平進行了相關性分析,發現了二者存在一定程度上的相關性。[5]才外,肖丙秀等課題組使用通用引物進行逆轉錄,可以用一次RT產物用于檢測多種miRNA,很大程度上節省了寶貴的材料,也提高了檢測的效率,對于臨床分析有很高的參考價值。[6]
3miRNA芯片技術
這種技術包括微陣列芯片技術和微流體芯片技術。微陣列芯片技術是將大量的寡核苷酸以高度有序的微陣列的形式排列在某種固相支持物上從而檢測特定基因表達。優點是可以一次就可以高通量的分析多個基因的表達情況,而且可以鑒別特意表達的基因。而微流體芯片技術是根據經典的分離理論,也就是不同大小的分子其流動性也不同。肖丙秀等課題組利用該技術初步鑒定出了一批在胃癌組織中高表達的miRNA:R-20b、miR-20a,miR-17、miR-106a,miR-18a,miR-21,miR-106b,miR-18b,miR-421、miR-340+、miR-19a和miR-65,為胃癌的診斷提供了有價值的參考資料。Tan等也利用該技術建立了腦卒中患者外周血miRNA的表達譜。此外采用該技術還可以實現對miRNA表達的絕對定量,具體方法為先測定標本中所有miRNA的表達譜,然后挑選出若干不表達的miRNA,隨后在標本中按照濃度梯度定量加入這些miRNA進行水平雜交,最后再測定熒光強度,進而繪出標本中不同miRNA的熒光強度曲線,根據曲線確定其表達量。
為了使芯片技術更方便于開展標準化檢測和質量控制,美國食品藥品監督管理局在2005年展開了一項芯片質量控制計劃,該計劃正致力于miRNA芯片檢測的標準化研究,這對該技術走向臨床領域有著重要的借鑒意義。最新發展起來的miRNA檢測技術中,共振能量轉移技術可以使用QDs做標記物對生物大分子的活性沒有傷害,比較適于活細胞內miRNA的分析。這里重點介紹下生物傳感器技術。目前在醫學檢驗領域,生物傳感器發揮著越來越重要的作用。生物傳感器是由生物識別部分和高度靈敏的信號傳感放大器件構成。有很多的優點,比如體積小、靈敏度高、成本低、檢測迅速和易于自動化等。其中在核酸檢測中,生物識別部分主要是負責特異性結合待測核苷酸。近幾年來納米技術的引入大大提高了miRNA檢測的準確性和靈敏性,這種方法迅速壯大。有希望成為臨床檢測各種疾病標志物的有效方法。
作者:陳躍龍 單位:楚雄醫藥高等專科學校