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1文獻精讀方法
科研論文討論是科研單位慣行的學(xué)術(shù)活動形式,講解者在精讀文獻的基礎(chǔ)上通過PPT來解讀文獻內(nèi)容,通常包括研究小組簡介、課題背景介紹、研究結(jié)果解析和討論幾個部分。在講解中,通過不斷提出科學(xué)問題,逐層深入地展示研究結(jié)果?;脽粢蟊尘按蠓?,字跡清楚。
2文獻專題選擇
教學(xué)過程中經(jīng)典理論教學(xué)與專題討論課教學(xué)這兩條主線需要相互配合,相得彰宜。因此,對于文獻專題的選則應(yīng)當把握三個原則:所選文獻專題確系當今醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)研究領(lǐng)域的前沿與熱點問題(高于課本);專題與經(jīng)典理論相聯(lián)系(不脫離課本);專題內(nèi)容為教學(xué)過程中學(xué)生興趣較濃、質(zhì)疑較多而課本講授深度有限的內(nèi)容(符合學(xué)生興趣)。在一門課程教學(xué)的具體實施中,根據(jù)以上三個原則,由教學(xué)組全體教師共同擬定4-5個文獻專題,而后在國際權(quán)威科學(xué)雜志如《自然》、《科學(xué)》及《細胞》上就每一個專題選擇近年來發(fā)表的5篇文獻,并指定各專題的輔導(dǎo)教師。文獻內(nèi)容以能夠體現(xiàn)該專題重要科學(xué)概念、里程碑式科學(xué)發(fā)現(xiàn)及先進的研究技術(shù)方法為標準。文獻選定后,由學(xué)生依據(jù)自身興趣自主選擇,就某一專題形成興趣小組。經(jīng)過一段時期的分組學(xué)習(xí)及教師輔導(dǎo),最終由每個小組推選兩名報告人,在本專題內(nèi)選定兩篇精讀文獻,以科研論文討論的形式進行學(xué)生課堂匯報。例如在《分子遺傳學(xué)》的理論教學(xué)中,講授了 “表觀遺傳學(xué)”內(nèi)容,但囿于課本內(nèi)容的深度及課時數(shù),僅介紹了其基本概念和發(fā)展簡史。然而,學(xué)生在課后提問中表現(xiàn)出強烈興趣,該專題也無疑是當今生命科學(xué)研究領(lǐng)域的熱點研究問題。作者就這一專題選定了5篇文獻,其中2007年12月發(fā)表在《細胞》雜志上的一篇題為《HistonecrosstalkbetweenH2B monoubiq-uitinationandH3 methylationmediatedbyCOM-PASS》的文章引起了學(xué)生的熱烈討論,并被選定為精讀及課堂匯報文獻之一。
3學(xué)生課堂匯報
學(xué)生課堂匯報安排在復(fù)習(xí)指導(dǎo)課之前1-2周,讓學(xué)生在結(jié)束文獻精讀訓(xùn)練后,轉(zhuǎn)而全身心投入復(fù)習(xí)考試過程。匯報課由主講教師主持,學(xué)生代表依次上臺,以幻燈為輔助進行匯報陳述,教研室主任、教授及教學(xué)組全體教師共同參與討論,并給予點評。以上述表觀遺傳學(xué)文章為例,學(xué)生代表先介紹了完成該研究工作的美國研究小組,而后介紹了與課題密切相關(guān)的研究背景:組蛋白(Histone,H)泛素化與組蛋白甲基化,與理論課上講授的基本概念密切相關(guān)。作者在《分子遺傳學(xué)》的DNA結(jié)構(gòu)中講過,一個核小體由兩個H2A,兩個H2B,兩個H3,兩個H4組成的八聚體和147個堿基(bp)纏繞在外面的DNA組成。在哺乳動物基因組中,組成核小體的組蛋白游離在外的N-端可以受到乙?;?,甲基化,磷酸化,泛素化等修飾,從而影響基因的轉(zhuǎn)錄活性。而本篇文獻則重點討論H2B泛素化與H3甲基化之間的關(guān)系。在對研究結(jié)果的講解中,學(xué)生用逐步深入的科學(xué)問題作為邏輯主線,體現(xiàn)出文章作者的科學(xué)研究思路。作者首先根據(jù)H2B泛素化影響H3甲基化這一保守的生物現(xiàn)象,提出了三種假說:
①調(diào)節(jié)泛素化的Rad6復(fù)合物可影響調(diào)節(jié)甲基化的COMPASS復(fù)合物中Set1組分的活性;
②Rad6復(fù)合物可影響COMPASS復(fù)合物中其它組分的活性;
③Rad6復(fù)合物影響COMPASS復(fù)合物中各組分的組裝、穩(wěn)定性及活性。而后,作者采用酵母Rad6突變體與野生型相對照,利用色譜分析、蛋白雙向電泳、染色質(zhì)免疫共沉淀等生物技術(shù),對三種假說依次進行驗證和排除,最終揭示Rad6復(fù)合物通過影響COMPASS復(fù)合物中Csp35(而非Set1)這一關(guān)鍵組分與染色質(zhì)的結(jié)合,實現(xiàn)H2B泛素化對H3甲基化的調(diào)控作用。通過文獻精讀,學(xué)生從表觀遺傳學(xué)的基本概念(如組蛋白甲基化、泛素化)出發(fā),進入到基本而又深刻的科學(xué)問題(如:泛素化與甲基化的相互關(guān)系是什么?),了解到上述確切的科學(xué)研究結(jié)論,以及尋找科學(xué)結(jié)論所需的生物技術(shù)方法。這個學(xué)習(xí)過程,在引申了經(jīng)典理論知識的同時,教會了學(xué)生自主學(xué)習(xí)前沿知識的方法,有效地培養(yǎng)了本科學(xué)生的科學(xué)研究素質(zhì)。
4文獻討論、點評
在文獻討論過程中,鼓勵學(xué)生最大限度的發(fā)揮主動性與創(chuàng)造力,發(fā)表自己的見解。以上述表觀遺傳學(xué)文章為例,H2B泛素化對于H3甲基化的影響不僅存在于第4位賴氨酸上(H3K4),也存在于第79位賴氨酸上(H3K79),而該文獻的研究對象僅限于前者。有學(xué)生在完成文獻精讀后,就H2B泛素化對H3K79甲基化的影響機制提出了自己的假說。教師對于有獨到見解,甚至能提出假說的學(xué)生給予高度贊揚,并鼓勵其撰寫科學(xué)假說論文,進一步鍛煉自己的科研素質(zhì)。在每一名學(xué)生的匯報及討論結(jié)束后,教研室主任、教授給予點評,在肯定其優(yōu)點的同時指出存在的問題和不足。問題通常表現(xiàn)在背景知識介紹不充分、邏輯主線不明晰、以及研究方法講解不清等方面。通過點評,使學(xué)生進一步明確文獻精讀的方法及需注意的問題。在整個教學(xué)實踐中,通過方法講解———實踐———總結(jié)的過程,最大程度地使學(xué)生在掌握經(jīng)典理論的同時,學(xué)會通過閱讀科研文獻汲取學(xué)科前沿知識,筑牢科研基本功。這一教學(xué)模式,可幫助醫(yī)科學(xué)生適應(yīng)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)高速發(fā)展現(xiàn)狀,是對研究型本科教學(xué)方法的有效探索。
作者:鄭敏化 秦鴻雁 馮蕾 韓驊 單位:第四軍醫(yī)大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與發(fā)育生物學(xué)教研室