生物技術(shù)數(shù)據(jù)分析精選(九篇)

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第1篇：生物技術(shù)數(shù)據(jù)分析范文

（玉溪師范學(xué)院資源環(huán)境學(xué)院，云南 玉溪 653100）

摘要：利用原子吸收分光光度計(jì)和原子熒光分光光度計(jì)，對(duì)云南省不同產(chǎn)地的12個(gè)食用薯蕷（Dioscorea spp．）樣品進(jìn)行了Na、Mg、Cr、Mn、Fe、Ni、Cu、Zn、Pb、As 10種無機(jī)元素含量的測(cè)定，并應(yīng)用spss 軟件對(duì)其進(jìn)行了主成分分析與聚類分析。結(jié)果顯示，主成分分析提取的前3個(gè)主因子含有云南食用薯蕷中無機(jī)元素85．345％的信息，第一個(gè)主因子的貢獻(xiàn)率達(dá)53％以上，其特征無機(jī)元素為Fe、Mg、As、Zn、Pb、Cr、Na。聚類分析將所有樣品分為兩類，以無機(jī)元素含量為指標(biāo)進(jìn)行聚類分析可以將不同種的食用薯蕷進(jìn)行區(qū)分。說明利用主成分分析和聚類分析對(duì)薯蕷無機(jī)元素進(jìn)行分析是可靠有效的，研究結(jié)果可為藥食兩用的植物資源利用提供參考。

關(guān)鍵詞 ：薯蕷（Dioscorea spp．）；原子吸收；原子熒光；無機(jī)元素；主成分分析；聚類分析；云南省

中圖分類號(hào)：S632．1；O657．31；S312（274） 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：0439－8114（2015）06－1399-04

DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.06.030

Principal Component Analysis and Clustering Analysis of Inorganic Elements

of Edible Yam in Yunnan Province

ZHANG Ya，YANG Ya－li，SHEN Tao，ZHENG Li，DOU Xiao－ji，HU Zhi－xuan，JIA Lin

（College of Resources and Environment of Yuxi Normal University， Yuxi 653100， Yunnan， China）

Abstract： The contents of elements including Na，Mg，Cr，Mn，F(xiàn)e，Ni，Cu，Zn， Pb and As in twelve yam （Dioscorea spp．） samples were determined by means of Atomic absorption spectrophotometer and Atomic fluorescence spectrophotometer． The principal component analysis of SPSS and cluster analysis were used to study characteristic elements in yam． The results showed that three principal components accounting for over 85．345％ of the total variance were extracted from the original data． Fe，Mg，As，Zn，Pb，Cr and Na were the characteristic elements in yam. The samples were clustered into two groups. Different yam varieties were distinguished by cluster analysis with amount of inorganic elements． The results of Principal component analysis and Clustering analysis showed that the samples were clustered into five groups. The characteristics of elemental distribution were related to the breeds of yam. It will provide reference for utilizing resources utilization of medicinal and edible plants．

Key words： yam（Dioscorea spp．）； atomic absorption； atomic fluorescence； inorganic elements； principal component analysis； clustering analysis； Yunnan province

收稿日期：2014－06－03

基金項(xiàng)目：云南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目（2013FD050）；玉溪師范學(xué)院大學(xué)生創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)計(jì)劃項(xiàng)目（2011A05）

作者簡介：張 亞（1990－），男，云南玉溪人，2011級(jí)本科生，研究方向?yàn)橹参镔Y源評(píng)價(jià)研究，（電話）13708691525；通信作者，賈 琳（1980－），女，

云南玉溪人，講師，碩士，主要從事蘭科植物遺傳多樣性和物種保護(hù)的研究；（電子信箱）sdauyail@163．com。

薯蕷屬（Dioscorea spp．）植物屬于百合目（Liliales）薯蕷科（Dioscoreaceae），為一年生或多年生的纏繞性藤本植物［1］。薯蕷肥大的地下肉質(zhì)塊莖可供食用或藥用，具有很高的營養(yǎng)價(jià)值及補(bǔ)脾養(yǎng)胃、生津益肺等藥用價(jià)值［2］。目前，對(duì)于薯蕷中薯蕷皂素及重金屬元素的研究已有較多報(bào)道［3－7］，這些研究多見于藥用薯蕷的有效成分及安全性的探討，對(duì)于食用薯蕷征元素的研究較少。化學(xué)計(jì)量學(xué)是分析化學(xué)處理數(shù)據(jù)的強(qiáng)有力工具，其中主成分分析和聚類分析是最常用的方法。主成分分析是一種將多個(gè)指標(biāo)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)的統(tǒng)計(jì)分析方法，能夠用少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)來反映大量原始指標(biāo)的主要信息，使問題簡化并得以解決。聚類分析是根據(jù)研究對(duì)象的特征、對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行分類的方法，是應(yīng)用最為廣泛的分類技術(shù)［8］。目前國內(nèi)外的學(xué)者已將主成分分析和聚類分析用于醫(yī)學(xué)、食品、農(nóng)業(yè)、環(huán)境等諸多領(lǐng)域［9－20］，運(yùn)用這兩種統(tǒng)計(jì)分析方法對(duì)食用薯蕷開展研究是可靠且具有現(xiàn)實(shí)意義的。試驗(yàn)基于對(duì)云南省所產(chǎn)食用薯蕷中10種無機(jī)元素的分析測(cè)定，確定其特征元素，利用SPSS軟件對(duì)其進(jìn)行主成分分析與聚類分析，以期為藥食兩用的植物資源利用提供參考。

1 材料與方法

1．1 材料

1．1．1 薯蕷樣品 在云南省玉溪市和紅河哈尼族彝族自治州等地，分別采集了12個(gè)薯蕷樣品，樣品編號(hào)及產(chǎn)地見表1。

1．1．2 試劑 硝酸、高氯酸、鹽酸、硫酸均為國產(chǎn)優(yōu)級(jí)純?cè)噭螂鍨榉治黾冊(cè)噭?/p>

1．1．3 儀器 試驗(yàn)所用儀器主要有TAS－990型原子吸收分光光度計(jì)（北京普析通用儀器公司）、AFS－3100型原子熒光分光光度計(jì)（北京海光儀器公司）、AR1140型萬分之一分析天平（梅特勒－托利多儀器公司）、DDL－4x1KW型控溫電爐（金壇市金城國勝實(shí)驗(yàn)儀器廠）、SRJX－8－13型高溫馬弗爐（北京市永光醫(yī)療儀器廠）、BPZ－6033LC型真空干燥箱（上海一恒科學(xué)儀器有限公司）、Milli－Q Academic純水系統(tǒng)（美國Millipore公司）。

1．2 方法

1．2．1 樣品預(yù)處理 先將各地樣品取整株新鮮薯蕷進(jìn)行拍照鑒定；鑒定后用軟毛刷刷洗塊莖表面，再以自來水沖洗干凈，去離子水淋洗3遍；瀝水后置于濾紙上充分吸干，適當(dāng)粉碎后放入烘箱干燥，樣品烘干后取出粉碎，置于干燥器中備用。

1．2．2 樣品消化與測(cè)定 試驗(yàn)在供試薯蕷中測(cè)定的無機(jī)元素分別是Na、Mg、Cr、Mn、Fe、Ni、Cu、Zn、Pb、As。取樣品4 g（精確至0．000 1 g）置于250 mL錐形瓶中，加入硝酸－高氯酸（V/V＝5∶1）混合液30 mL，于控溫電爐上加熱，待樣品不再產(chǎn)生棕色氣體時(shí)，升高電爐溫度，至瓶內(nèi)液體體積為1 mL左右時(shí)取下，冷卻，用去離子水無損地轉(zhuǎn)移至50 mL比色管中，定容搖勻，然后分別測(cè)定Na、Mg、Cr、Mn、Fe、Ni、Cu、Zn、Pb的含量。另稱取樣品2 g（精確到0．000 1 g）于50 mL瓷坩堝中，于控溫電爐上碳化至無黑煙，移入550 ℃高溫馬弗爐中灰化4 h，取出冷卻后，小心加入1∶1的鹽酸10 mL溶解灰分，無損地轉(zhuǎn)移至25 mL比色管中，加入50 g/L的硫脲2．5 mL，再用1∶9的硫酸分次涮洗坩堝后轉(zhuǎn)入比色管中，定容搖勻后測(cè)定As的含量。

1．3 數(shù)據(jù)處理

應(yīng)用SPSS 19．0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)試驗(yàn)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，采用Z－score方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，再分別進(jìn)行主成分分析和聚類分析。

2 結(jié)果與分析

2．1 云南食用薯蕷中無機(jī)元素含量

通過測(cè)定分析，得到云南食用薯蕷中10種無機(jī)元素的含量，具體見表2。根據(jù)表2中測(cè)定的無機(jī)元素含量，制作各元素的分布曲線；為了繪圖的方便并便于比較，把Mg含量降低至1/10；把Fe含量降至1/100；把總砷含量擴(kuò)大至100倍，使三者與其他元素處于同一數(shù)量級(jí)水平處在同一分布圖中，結(jié)果見圖1。由圖1可以看出，在12個(gè)薯蕷樣品中，F(xiàn)e、Mg、Na、Zn、Cu為含量較高的元素，無機(jī)元素含量幾乎均表現(xiàn)為相似的峰形，且這一相似的峰形和無機(jī)元素含量均呈現(xiàn)為Fe＞Mg＞Na＞Zn＞Cu的趨勢(shì)。

2．2 主成分分析

運(yùn)用SPSS 19．0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分分析，得到的相關(guān)系數(shù)矩陣見表3。由表3可以看出，63．6％的數(shù)據(jù)其絕對(duì)值大于0．30，各變量兩兩之間有較大的相關(guān)系數(shù)；因此適宜用主成分分析法來研究變量之間的關(guān)系，從而得到相關(guān)系數(shù)的特征根和方差貢獻(xiàn)率，具體見表4。如表4所示，前3個(gè)因子的累積貢獻(xiàn)率達(dá)到85．345％，大于85％，特征根為：λ1＝5．342，λ2＝2．162，λ3＝1．031；故選前3個(gè)作為主成分。

表5為因子載荷矩陣，其中的每一個(gè)載荷量表示主成分與對(duì)應(yīng)變量的相關(guān)系數(shù)。從表5可見，第一個(gè)主成分與Fe、Mg、As、Zn、Pb、Cr、Na的相關(guān)系數(shù)較大，第二個(gè)主成分與Ni明顯正相關(guān)，與Cu明顯負(fù)相關(guān)，第三個(gè)主成分與Mn的相關(guān)系數(shù)較大，這3個(gè)主成分幾乎反映了云南食用薯蕷中無機(jī)元素的所有信息。

2．3 聚類分析

試驗(yàn)采用系統(tǒng)聚類分析Q聚類法對(duì)12個(gè)樣品進(jìn)行聚類分組，用歐氏距離平方法測(cè)量，每兩兩樣本間用Ward’s法連結(jié)，聚類分析結(jié)果見圖2。從圖2分析可知，12個(gè)樣品可聚為兩類，其中S3、S6、S7、S8、S9、S10、S12聚為第一類；S1、S2、S4、S5、S11聚為第二類；第一類主要為參薯，第二類主要是云南薯蕷和毛膠薯蕷。這表明聚類分析的結(jié)果可以在一定程度上反映物種間的親緣關(guān)系。除S11外，來自不同產(chǎn)地的參薯可聚為一類，日本薯蕷與參薯同屬薯蕷屬周生翅組，親緣關(guān)系較近，也聚為一類；同屬頂生翅組的毛膠薯蕷與云南薯蕷聚為一類。結(jié)合無機(jī)元素含量來看，第二類薯蕷中，其Fe、Mg、Na和Zn的含量高于第一類。

3 小結(jié)與討論

試驗(yàn)結(jié)果表明，在云南省玉溪市和紅河哈尼族彝族自治州等地所采集的12個(gè)食用薯蕷樣品中含量較高的無機(jī)元素為Fe、Mg、Na、Zn、Cu，其含量表現(xiàn)為Fe＞Mg＞Na＞Zn＞Cu的趨勢(shì)，故可以此種趨勢(shì)作為云南食用薯蕷無機(jī)元素指紋譜而與其他薯蕷類及其制品在無機(jī)元素指紋譜上的區(qū)別特征。

主成分分析結(jié)果表明，前3個(gè)主因子含有云南食用薯蕷中無機(jī)元素85．345％的信息，總方差53％以上的貢獻(xiàn)來自第一個(gè)主因子，可以認(rèn)為Fe、Mg、As、Zn、Pb、Cr、Na是云南食用薯蕷的特征無機(jī)元素。魏玉明等［21］研究表明，Cr、Mn、Fe、Ni、Cd、Hg是穿龍薯蕷（D． nipponica Makino）的特征無機(jī)元素，這說明藥用薯蕷與食用薯蕷的特征無機(jī)元素是不同的，可用此來進(jìn)行區(qū)分。

聚類分析結(jié)果表明，以無機(jī)元素含量為指標(biāo)進(jìn)行聚類分析可在一定程度上反映云南食用薯蕷物種間的親緣關(guān)系，能夠?qū)⒉煌N的食用薯蕷進(jìn)行區(qū)分。楊在君等［11］的研究表明，以微量元素含量為指標(biāo)，采用聚類分析對(duì)丹參（Salvia miltiorrhiza Bge．）及其近緣種植物進(jìn)行分類，可將丹參和其他鼠尾草屬（Salvia L．）植物區(qū)分開來；陳蘭珍等［22］對(duì)不同種類的蜂蜜進(jìn)行了研究，結(jié)果表明，不同種類蜂蜜中微量元素的含量有較大的差別；尹海波等［23］、徐敏等［24］、等［25］分別對(duì)不同產(chǎn)地的牻牛兒苗（Erodium stephanianum Willd．）、川黃柏（Phellodendron chinense Schneid）和當(dāng)歸［Angelica sinensis（Oliv．）Diels］所含的無機(jī)元素進(jìn)行聚類分析，結(jié)果表明，無機(jī)元素的分布特征與產(chǎn)地和種質(zhì)呈一定的相關(guān)性。本研究結(jié)果也表明，相同產(chǎn)地的不同種食用薯蕷其無機(jī)元素含量存在較大的差異，人們?cè)谑秤眠^程中可根據(jù)需要進(jìn)行選擇。

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第2篇：生物技術(shù)數(shù)據(jù)分析范文

關(guān)鍵詞：人口性別構(gòu)成；空間結(jié)構(gòu)；影響因素；應(yīng)對(duì)策略；云南省

中圖分類號(hào)：C92 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：1673-291X（2017）01-0110-04

人口性別結(jié)構(gòu)是一個(gè)國家或地區(qū)兩性人口數(shù)量的比例關(guān)系[1]。其影響人口出生率和死亡率，與人口自身增長和社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展有著直接聯(lián)系。一個(gè)國家或地區(qū)的人口性別比過高或過低都是不正常的，均會(huì)造成一系列的社會(huì)問題。

本文通過收集第五次、第六次全國人口普查資料，對(duì)16個(gè)地州市的人口性比重、性別比等數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比分析，深入了解人口性別構(gòu)成的地區(qū)、城鄉(xiāng)差異，探討人口性別結(jié)構(gòu)形成的影響因素，并提出改善人口性別結(jié)構(gòu)的對(duì)策與措施。

一、云南省人口性別結(jié)構(gòu)的總體狀況

從一普到五普，性別比均呈上升趨勢(shì)，與2000年相比較，到2010年，性別比下降了2.3個(gè)百分點(diǎn)。性別比低于105，屬正常，性別比為105～107，屬正常或略偏高，性別比高于107，屬略偏高或偏高[1]，一普、二普、三普時(shí)屬正常，四普時(shí)屬正常或略偏高，五普、六普時(shí)屬略偏高或偏高，五普時(shí)最高，為110.1[2]（見表1）。

二、云南省人口性別結(jié)構(gòu)的地區(qū)狀況

（一）性別比總體呈下降趨勢(shì)，但仍高于全國水平，降幅存在明顯的地區(qū)差異

與2000年的110.06相比較，2010年下降了2.22個(gè)百分點(diǎn)，為107.84，但仍高于全國2000年106.74和2010年105.20的水平。從16個(gè)地州市來看，除了玉溪、昭通、麗江、德宏和迪慶持續(xù)升高外，其他11個(gè)地州市都呈下降趨勢(shì)。上升幅度最大的是迪慶州，為4.78個(gè)百分點(diǎn)，下降幅度最大的是普洱市，為6.87個(gè)百分點(diǎn)。2010年，性別比最高的是迪慶州，為113.88，最低的是大理州，為102.82（見下頁表2）。

（二）性別比呈東北略偏高，西南偏高，西北最高，中部最低的空間結(jié)構(gòu)

2010年，大理和楚雄性別比低于105，屬正常，保山、玉溪、昆明人口性別比略高于105，也屬正常，德宏、麗江性別比為106～107，屬正常略偏高，版納、紅河、文山性別比107～110，屬略偏高，臨滄、昭通、曲靖、普洱、怒江、迪慶性別比都高于110，屬偏高。總體來看，性別比構(gòu)成呈東北略偏高，西南偏高，西北最高，中部最低的空間結(jié)構(gòu)。

（三）隨著孩次的增加，性別比大多呈升高的趨勢(shì)

從云南省2009年11月1日―2010年10月31日分孩次性別比來看，隨著孩次的增加，性別比大多呈升高趨勢(shì)，從第一孩次到第五孩次及以上，最高的地區(qū)分別是昭通、迪慶、楚雄、德宏和普洱（見表3）。

三、云南省人口性別結(jié)構(gòu)的城鄉(xiāng)狀況

（一）性別比普遍呈下降趨勢(shì)，降幅在城鄉(xiāng)和地區(qū)上存在明顯的差異性

從五普、六普相關(guān)數(shù)據(jù)來看，與2000年相比較，城市人口性別比下降了6.8個(gè)百分點(diǎn)，鎮(zhèn)下降了3.31個(gè)百分點(diǎn)，縣或村下降了0.58個(gè)百分點(diǎn)。

（二）性別比呈縣或村普遍高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市的空間結(jié)構(gòu)

到2010年，除了版納、大理、德宏呈城市高于鎮(zhèn)的空間格局外，其他地州市都普遍呈鎮(zhèn)高于城市，除了怒江是鎮(zhèn)高于縣或村外，其他地州市都呈縣或村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市。總體來看，性別比的城鄉(xiāng)空間結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是縣或村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市（見下頁表4）。

（三）出生嬰兒性別比總體呈上升趨勢(shì)，鄉(xiāng)村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市的城鄉(xiāng)格局

與2000年相比較，出生嬰兒性別比總體上升了1.55個(gè)百分點(diǎn)，城市上升了4.48個(gè)百分點(diǎn)，鎮(zhèn)上升了4.47個(gè)百分點(diǎn)，縣或村上升了1.04個(gè)百分點(diǎn)。五普、六普城鄉(xiāng)出生嬰兒性別比均呈鄉(xiāng)村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市的城鄉(xiāng)格局（見表5）。

城鄉(xiāng)人口性別比隨年齡增高而下降，年齡別性別比呈縣或村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市的空間格局，分年齡別性比重男性大于女性，隨著年齡的增長呈相反趨勢(shì)[3～4]。2010年，到64歲組以后，性別比下降到100以下[4]。中國分年齡性別比要到70歲才跌破100[1]，比中國平均水平提前了6歲，其反常及負(fù)面影響不言而喻。

四、云南省人口性別結(jié)構(gòu)形成的影響因素分析

首先，出生嬰兒性別比過高或偏高問題存在，且城鄉(xiāng)差異明顯。生育率下降，生活水平提高，衛(wèi)生條件改善，特別是流產(chǎn)率的下降，均會(huì)提高出生嬰兒性別比[1]。出生人口性別比偏高會(huì)降低出生人口規(guī)模、加速人口老齡化以及造成婚姻擠壓等人口后果[5]。其次，經(jīng)濟(jì)欠發(fā)達(dá)地區(qū)，對(duì)生育男孩的偏好較強(qiáng)，如怒江、迪慶、曲靖、昭通、普洱、臨滄、德宏等地區(qū)。經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平較高的中部地區(qū)性別比偏低，如昆明、玉溪、楚雄等地。而大理州性別比偏低與當(dāng)?shù)匕鬃寰用裆耘疄橄玻魍猓兄鲀?nèi)，女人可以承擔(dān)更多的家務(wù)勞動(dòng)和社會(huì)責(zé)任密切相關(guān)。再次，受兩性死亡率、年齡別兩性人口保存幾率差異的影響，人口年齡結(jié)構(gòu)的加速老化對(duì)改善人口性別結(jié)構(gòu)起著越來越重要的作用[6]。最后，人口遷移對(duì)我國各省區(qū)性別比的差別影響，根據(jù)2010年第六次人口普查數(shù)據(jù)，云南省屬于女性凈遷出大于男性凈遷出[1]的情況，致使性別比上升。受到國民經(jīng)濟(jì)各部門就業(yè)人口的性別結(jié)構(gòu)要求不同的影響，一些煤礦城市和重工業(yè)城市的人口性別比較高，比如曲靖市。

五、討論

云南省人口性別比呈下降趨勢(shì)，總體水平高，性別比的地區(qū)、城鄉(xiāng)差異明顯。人口性別比構(gòu)成總體上呈東北略偏高，西南偏高，西北最高，中部最低的空間格局，呈縣或村高于鎮(zhèn)，同時(shí)又高于城市的城鄉(xiāng)結(jié)構(gòu)特征。對(duì)此，可以采取以下措施來改善人口性別結(jié)構(gòu)失衡問題：加對(duì)民眾的宣傳教育，消除重男輕女的思想意識(shí)，防止由于孩次增加引起的地區(qū)性別比嚴(yán)重失衡；提高婦女的社會(huì)地位，要切實(shí)保障女性人口在社會(huì)中的平等地位，這樣才會(huì)從根本上減輕育齡夫婦對(duì)男性嬰兒的偏好，減少出生人口性別的人為選擇[7]。加強(qiáng)對(duì)基層醫(yī)療衛(wèi)生管理部門的監(jiān)管力度，嚴(yán)禁非醫(yī)學(xué)需要的胎兒性別鑒定，非醫(yī)學(xué)需要的選擇性別終止妊娠[8]。完善法規(guī)制度，確保女嬰、女童的合法權(quán)益。加快欠發(fā)達(dá)地區(qū)經(jīng)濟(jì)發(fā)展步伐，不斷健全和完善養(yǎng)老保障體制。

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Yunnan Province Population Gender Composition’s Spatial Structure，Influencing Factors and Coping Strategies：Based on the Analysis of the Census Data of the Fifth and the Sixth

CHEN Xi-qiong

（City College of Qujing Normal University，Qujing 655011，China）